Det fanns en tid då vi i västvärlden censurerade delar av namnet på Turtles till följd av olämpliga ord som "ninja". Idag är situationen i någon utsträckning omvänd. Senaste exemplet är kommande Deus Ex: Human Revolution rapporterar Siliconera.
I den japanska versionen har man plockat bort en sekvens där man får se ett organ samt en annan sekvens där någon form av sexuellt objekt visas. Spelet som släpps i slutet av denna månad till PC, Playstation 3 och Xbox 360 har dock fortfarande en Cero Z-märkning i Japan vilket motsvarar 18+.